Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HNF4GQ14541 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HNF4GQ14541 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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