Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM29Q14134 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM29Q14134 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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