Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARB2Q14108 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCARB2Q14108 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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