Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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COL9A2Q14055 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COL9A2Q14055 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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