Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE7AQ13946 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE7AQ13946 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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