Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP1A4Q13733 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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