Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL1Q13616 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL1Q13616 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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