Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRR1Q13601 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRR1Q13601 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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