Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PKD2Q13563 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PKD2Q13563 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PKD2Q13563 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PKD2Q13563 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKD2Q13563 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PKD2Q13563 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
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