Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XRCC4Q13426 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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