Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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