Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP140Q13342 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP140Q13342 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP140Q13342 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP140Q13342 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP140Q13342 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SP140Q13342 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SP140Q13342 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SP140Q13342 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SP140Q13342 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SP140Q13342 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SP140Q13342 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP140Q13342 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP140Q13342 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP140Q13342 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP140Q13342 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP140Q13342 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP140Q13342 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SP140Q13342 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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