Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SRSF5Q13243 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SRSF5Q13243 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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