Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2BQ13224 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
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