Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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SEMA3BQ13214 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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SEMA3BQ13214 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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SEMA3BQ13214 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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SEMA3BQ13214 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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