Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFX1Q12986 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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