Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXC1Q12948 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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FOXC1Q12948 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXC1Q12948 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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