Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TP53BP1Q12888 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TP53BP1Q12888 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms