Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFEMP1Q12805 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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