Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 YKL111CYKL111C 336 nt1.9□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 RMP1YLR145W 606 nt1.9□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 ATP15YPL271W 189 nt1.9□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YPR172WYPR172W 603 nt1.9□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YCL023CYCL023C 348 nt1.9□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.9□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 BRP1YGL007W 378 nt1.89□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 SMD1YGR074W 441 nt1.89□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 VOA1YGR106C 798 nt1.89□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 TEN1YLR010C 483 nt1.89□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YLR053CYLR053C 327 nt1.89□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YBL012CYBL012C 402 nt1.89□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 SWS2YNL081C 432 nt1.89□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 SNC2YOR327C 348 nt1.89□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 ALK2YBL009W 2031 nt1.89□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 SNF5YBR289W 2718 nt1.88□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YJL016WYJL016W 1686 nt1.88□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 HOP2YGL033W 657 nt1.88□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YNR025CYNR025C 360 nt1.88□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 PDR8YLR266C 2106 nt1.88□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 GYP5YPL249C 2685 nt1.88□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 HCS1YKL017C 2052 nt1.87□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 RPH1YER169W 2391 nt1.87□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 NUP82YJL061W 2142 nt1.87□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 VMR1YHL035C 4779 nt1.87□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 SEC31YDL195W 3822 nt1.87□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YDR286CYDR286C 345 nt1.87□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 EMP24YGL200C 612 nt1.87□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 RRF1YHR038W 693 nt1.87□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 RLP24YLR009W 600 nt1.87□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 BER1YLR412W 825 nt1.87□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 SPR3YGR059W 1539 nt1.86□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 GCN2YDR283C 4980 nt1.86□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YDL062WYDL062W 426 nt1.86□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YDR029WYDR029W 315 nt1.86□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YLR255CYLR255C 354 nt1.86□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 ROX1YPR065W 1107 nt1.86□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 FAB1YFR019W 6837 nt1.86□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 MNL2YLR057W 2550 nt1.86□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 MYO2YOR326W 4725 nt1.86□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.85□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.85□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 snR84snR84 550 nt1.85□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 MET32YDR253C 576 nt1.85□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 TMA7YLR262C-A 195 nt1.85□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 TUS1YLR425W 3924 nt1.85□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 PEX8YGR077C 1770 nt1.85□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 MUD2YKL074C 1584 nt1.85□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 DNF3YMR162C 4971 nt1.84□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 MGM1YOR211C 2646 nt1.84□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 NOP14YDL148C 2433 nt1.84□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 PAU3YCR104W 375 nt1.84□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 SMB1YER029C 591 nt1.84□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 PRM8YGL053W 714 nt1.84□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YPS5YGL259W 498 nt1.84□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 RTC6YPL183W-A 282 nt1.84□□□□□ -2.11
SFG1Q12507 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.84□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 CDC27YBL084C 2277 nt1.84□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 ATG9YDL149W 2994 nt1.83□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 BPH1YCR032W 6504 nt1.83□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 RPI1YIL119C 1224 nt1.83□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 SVS1YPL163C 783 nt1.83□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 GPX2YBR244W 489 nt1.83□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 HSH155YMR288W 2916 nt1.83□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 AGC1YPR021C 2709 nt1.82□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.82□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 GIC1YHR061C 945 nt1.82□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 ILM1YJR118C 612 nt1.82□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.82□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 SGD1YLR336C 2700 nt1.82□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 SPO22YIL073C 2928 nt1.81□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 SET2YJL168C 2202 nt1.81□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 IRC10YOL015W 1761 nt1.81□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 EMC4YGL231C 573 nt1.81□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.81□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 snR189snR189 189 nt1.81□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 MSH6YDR097C 3729 nt1.81□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 ATG11YPR049C 3537 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 MSS11YMR164C 2277 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 DIS3YOL021C 3006 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 BUD2YKL092C 3315 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 SMY1YKL079W 1971 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 YGL069CYGL069C 465 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 LSO2YGR169C-A 279 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 NCE101YJL205C 162 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 SEC22YLR268W 645 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 SEN15YMR059W 387 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 UBX4YMR067C 1251 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 KAR3YPR141C 2190 nt1.8□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 YDL016CYDL016C 303 nt1.79□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 IES5YER092W 378 nt1.79□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.79□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 RPA34YJL148W 702 nt1.79□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 CYB5YNL111C 363 nt1.79□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.79□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 NOT5YPR072W 1683 nt1.79□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 VPS35YJL154C 2835 nt1.79□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 IRE1YHR079C 3348 nt1.78□□□□□ -2.12
SFG1Q12507 SLM1YIL105C 2061 nt1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.4 ms