Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 SMD1YGR074W 441 nt0.7□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.7□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.7□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 GRX7YBR014C 612 nt0.7□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 VPS28YPL065W 729 nt0.7□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 RAD50YNL250W 3939 nt0.7□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 SEC3YER008C 4011 nt0.69□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.69□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YDL211CYDL211C 1119 nt0.69□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 QCR9YGR183C 201 nt0.69□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 NBL1YHR199C-A 222 nt0.69□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 PEP8YJL053W 1140 nt0.69□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 DLT1YMR126C 1029 nt0.69□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 MSC6YOR354C 2079 nt0.69□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 SPR3YGR059W 1539 nt0.69□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 SHS1YDL225W 1656 nt0.69□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 SEC1YDR164C 2175 nt0.68□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 GIC1YHR061C 945 nt0.68□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YLL020CYLL020C 306 nt0.68□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.68□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 AEP1YMR064W 1557 nt0.68□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 PIG2YIL045W 1617 nt0.67□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 UBP3YER151C 2739 nt0.67□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 GPM2YDL021W 936 nt0.67□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 LSM6YDR378C 261 nt0.67□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 SPC1YJR010C-A 285 nt0.67□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.67□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YNL179CYNL179C 438 nt0.67□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YOL050CYOL050C 321 nt0.67□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 MUM2YBR057C 1101 nt0.67□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 SMY1YKL079W 1971 nt0.66□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 snR63snR63 255 nt0.66□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 SNA4YDL123W 423 nt0.66□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.66□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YJL114WYJL114W 681 nt0.66□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YOR376WYOR376W 369 nt0.66□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 AME1YBR211C 975 nt0.66□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YDR338CYDR338C 2088 nt0.66□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 ARP9YMR033W 1404 nt0.65□□□□□ -2.3
RTR2Q12378 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.65□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 SDL1YIL167W 633 nt0.65□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 HIT1YJR055W 495 nt0.65□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 RAM2YKL019W 951 nt0.65□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.65□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 TIF11YMR260C 462 nt0.65□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 RLM1YPL089C 2031 nt0.64□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 NSE3YDR288W 912 nt0.64□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 PRP38YGR075C 729 nt0.64□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt0.64□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 POP8YBL018C 402 nt0.64□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 FYV6YNL133C 522 nt0.64□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YNR068CYNR068C 819 nt0.64□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YCK3YER123W 1575 nt0.64□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 NUP157YER105C 4176 nt0.63□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.63□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 NHP2YDL208W 471 nt0.63□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 VAB2YEL005C 849 nt0.63□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 PRS3YHL011C 963 nt0.63□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 HYR1YIR037W 492 nt0.63□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt0.63□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 CDC39YCR093W 6327 nt0.63□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YMR160WYMR160W 2451 nt0.62□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YAP3YHL009C 993 nt0.62□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YKE2YLR200W 345 nt0.62□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 IRC23YOR044W 474 nt0.62□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 SUT2YPR009W 807 nt0.62□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YCS4YLR272C 3531 nt0.61□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 SNF12YNR023W 1701 nt0.61□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YDR521WYDR521W 336 nt0.61□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.61□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 DIA1YMR316W 1011 nt0.61□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 SWM2YNR004W 441 nt0.61□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YNR021WYNR021W 1215 nt0.61□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 TRS20YBR254C 528 nt0.61□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 CMC4YMR194C-B 222 nt0.6□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 UTP20YBL004W 7482 nt0.6□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 ESA1YOR244W 1338 nt0.6□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 EMC5YIL027C 426 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 RPL16AYIL133C 600 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 VPS25YJR102C 609 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 TAP42YMR028W 1101 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 URA10YMR271C 684 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 YOL014WYOL014W 375 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 MGR1YCL044C 1254 nt0.59□□□□□ -2.31
RTR2Q12378 STB6YKL072W 2301 nt0.59□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.58□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.58□□□□□ -2.32
RTR2Q12378 CDC27YBL084C 2277 nt0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms