Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 ZRG8YER033C 3231 nt1.48□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 LYS9YNR050C 1341 nt1.48□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 MUD2YKL074C 1584 nt1.48□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YCR100CYCR100C 951 nt1.48□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.48□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YGL109WYGL109W 324 nt1.48□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 VOA1YGR106C 798 nt1.48□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 PHO80YOL001W 882 nt1.48□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 SPO24YPR036W-A 204 nt1.48□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt1.47□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YEL057CYEL057C 702 nt1.47□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 TMA20YER007C-A 546 nt1.47□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YAL066WYAL066W 309 nt1.47□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 CSI1YMR025W 888 nt1.47□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YNL150WYNL150W 408 nt1.47□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 YPL080CYPL080C 327 nt1.47□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 ROX1YPR065W 1107 nt1.47□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 POP7YBR167C 423 nt1.47□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 TBS1YBR150C 3285 nt1.47□□□□□ -2.17
MSH5Q12175 DPB11YJL090C 2295 nt1.46□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 ARV1YLR242C 966 nt1.46□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 ICY1YMR195W 384 nt1.46□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 PGA1YNL158W 597 nt1.46□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 ATG11YPR049C 3537 nt1.46□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 SXM1YDR395W 2835 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 DAS1YJL149W 1992 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 SKI3YPR189W 4299 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 SSK2YNR031C 4740 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 MNL2YLR057W 2550 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YER038W-AYER038W-A 381 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 BMT5YIL096C 1011 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 CMC2YBL059C-A 330 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YNL235CYNL235C 432 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 ATP15YPL271W 189 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 IRE1YHR079C 3348 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 BRR2YER172C 6492 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YSW1YBR148W 1830 nt1.45□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 PEX8YGR077C 1770 nt1.44□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 COX1Q0045 1605 nt1.44□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 ASM4YDL088C 1587 nt1.44□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 BNA7YDR428C 786 nt1.44□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 RNR4YGR180C 1038 nt1.44□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 GPX2YBR244W 489 nt1.44□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 CTF4YPR135W 2784 nt1.44□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 RRI2YOL117W 1938 nt1.44□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 HIR3YJR140C 4947 nt1.44□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 MDM20YOL076W 2391 nt1.43□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 URA10YMR271C 684 nt1.43□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 RTC6YPL183W-A 282 nt1.43□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YPR170CYPR170C 336 nt1.43□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 FRK1YPL141C 2598 nt1.43□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.42□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.42□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt1.42□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YCL020WYCL020W 1317 nt1.42□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YLR198CYLR198C 360 nt1.42□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.42□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 HKR1YDR420W 5409 nt1.42□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 PIK1YNL267W 3201 nt1.42□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 BPH1YCR032W 6504 nt1.42□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 MON2YNL297C 4911 nt1.42□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 KCS1YDR017C 3153 nt1.41□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 MCM22YJR135C 720 nt1.41□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 SDS22YKL193C 1017 nt1.41□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 CMS1YLR003C 876 nt1.41□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 TIF11YMR260C 462 nt1.41□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 IPP1YBR011C 864 nt1.41□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 RBL2YOR265W 321 nt1.41□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YBR287WYBR287W 1284 nt1.41□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YGR250CYGR250C 2346 nt1.41□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 NOT5YPR072W 1683 nt1.41□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.4□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.4□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 HMI1YOL095C 2121 nt1.4□□□□□ -2.18
MSH5Q12175 YDL068WYDL068W 330 nt1.4□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.4□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 RPL37AYLR185W 267 nt1.4□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 RPS7BYNL096C 573 nt1.4□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 AHC1YOR023C 1701 nt1.4□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YLR149CYLR149C 2193 nt1.4□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 MDM32YOR147W 1869 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 PMD1YER132C 5262 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 CTR9YOL145C 3234 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YAR068WYAR068W 486 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YBL083CYBL083C 426 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YPL039WYPL039W 951 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YCL002CYCL002C 792 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 PBY1YBR094W 2262 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 NUP82YJL061W 2142 nt1.39□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 BST1YFL025C 3090 nt1.38□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YCR043CYCR043C 384 nt1.38□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YJL119CYJL119C 324 nt1.38□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 TIM8YJR135W-A 264 nt1.38□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 RPC25YKL144C 639 nt1.38□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 DCP1YOL149W 696 nt1.38□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 YCL023CYCL023C 348 nt1.38□□□□□ -2.19
MSH5Q12175 SEC21YNL287W 2808 nt1.37□□□□□ -2.19
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