Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EP300Q09472 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EP300Q09472 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EP300Q09472 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EP300Q09472 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EP300Q09472 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EP300Q09472 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EP300Q09472 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EP300Q09472 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EP300Q09472 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EP300Q09472 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EP300Q09472 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EP300Q09472 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EP300Q09472 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EP300Q09472 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EP300Q09472 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EP300Q09472 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EP300Q09472 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EP300Q09472 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EP300Q09472 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms