Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNA1Q09470 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNA1Q09470 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms