Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE4CQ08493 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4CQ08493 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms