Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms