Protein–RNA interactions for Protein: Q06707

SWC7, SWR1-complex protein 7, yeastyeast

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWC7Q06707 YMR160WYMR160W 2451 nt0.65□□□□□ -2.3
SWC7Q06707 MSC6YOR354C 2079 nt0.65□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YLL020CYLL020C 306 nt0.65□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YNR068CYNR068C 819 nt0.65□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YGR250CYGR250C 2346 nt0.65□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 DAS1YJL149W 1992 nt0.65□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YGL177WYGL177W 348 nt0.64□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 ZRG8YER033C 3231 nt0.64□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 ECM25YJL201W 1800 nt0.64□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 SHS1YDL225W 1656 nt0.63□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.63□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.63□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 URM1YIL008W 300 nt0.63□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 HIT1YJR055W 495 nt0.63□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 FYV6YNL133C 522 nt0.63□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 SPR3YGR059W 1539 nt0.63□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YJL049WYJL049W 1353 nt0.62□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 NCL1YBL024W 2055 nt0.62□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YPD1YDL235C 504 nt0.62□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 PHS1YJL097W 654 nt0.62□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 STB6YKL072W 2301 nt0.62□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 SWI6YLR182W 2412 nt0.62□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 NUP145YGL092W 3954 nt0.61□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YCR090CYCR090C 549 nt0.61□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YDL211CYDL211C 1119 nt0.61□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.61□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 NBL1YHR199C-A 222 nt0.61□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 HYR1YIR037W 492 nt0.61□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 TIF11YMR260C 462 nt0.61□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YNL179CYNL179C 438 nt0.61□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 PRP16YKR086W 3216 nt0.6□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YDL073WYDL073W 2955 nt0.6□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YDR338CYDR338C 2088 nt0.6□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YDL157CYDL157C 357 nt0.6□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 LSM6YDR378C 261 nt0.6□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 SPC1YJR010C-A 285 nt0.6□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.6□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.6□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 IRC23YOR044W 474 nt0.6□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 APL3YBL037W 3078 nt0.6□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 RTR1YER139C 681 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 RRT16YNL105W 429 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 MGR1YCL044C 1254 nt0.59□□□□□ -2.31
SWC7Q06707 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.58□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 SWM2YNR004W 441 nt0.58□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YOR376WYOR376W 369 nt0.58□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 SMY1YKL079W 1971 nt0.57□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 RLM1YPL089C 2031 nt0.57□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 NSE3YDR288W 912 nt0.57□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 TSA2YDR453C 591 nt0.57□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.57□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 FIP1YJR093C 984 nt0.57□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.57□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 TIM18YOR297C 579 nt0.57□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 TRS20YBR254C 528 nt0.57□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 AEP1YMR064W 1557 nt0.57□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 PRS3YHL011C 963 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 GIC1YHR061C 945 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 EMC5YIL027C 426 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 RAM2YKL019W 951 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 DLT1YMR126C 1029 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 TEX1YNL253W 1269 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YNR021WYNR021W 1215 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YOR218CYOR218C 420 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 AME1YBR211C 975 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YCK3YER123W 1575 nt0.56□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 SET3YKR029C 2256 nt0.55□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 ARP9YMR033W 1404 nt0.55□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 CDC5YMR001C 2118 nt0.55□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 snR63snR63 255 nt0.55□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 SNA4YDL123W 423 nt0.55□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 VAB2YEL005C 849 nt0.55□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YJL114WYJL114W 681 nt0.55□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 DIA1YMR316W 1011 nt0.55□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.55□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 RKR1YMR247C 4689 nt0.54□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 QCR9YGR183C 201 nt0.54□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YAP3YHL009C 993 nt0.54□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt0.54□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 UTP20YBL004W 7482 nt0.53□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 PRP38YGR075C 729 nt0.53□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 PPE1YHR075C 1203 nt0.53□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 RPL40BYKR094C 387 nt0.53□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 PGA1YNL158W 597 nt0.53□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 VPS28YPL065W 729 nt0.53□□□□□ -2.32
SWC7Q06707 SNF12YNR023W 1701 nt0.52□□□□□ -2.33
SWC7Q06707 SWI4YER111C 3282 nt0.52□□□□□ -2.33
SWC7Q06707 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.52□□□□□ -2.33
SWC7Q06707 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.52□□□□□ -2.33
SWC7Q06707 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.52□□□□□ -2.33
SWC7Q06707 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms