Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABPAQ06546 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPAQ06546 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms