Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KDSRQ06136 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms