Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EN1Q05925 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EN1Q05925 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EN1Q05925 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EN1Q05925 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EN1Q05925 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EN1Q05925 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EN1Q05925 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EN1Q05925 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EN1Q05925 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EN1Q05925 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EN1Q05925 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EN1Q05925 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EN1Q05925 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EN1Q05925 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms