Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIN1Q05586 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIN1Q05586 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms