Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.21□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YER079C-AYER079C-A 339 nt3.21□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt3.21□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 AYR1YIL124W 894 nt3.21□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YOR050CYOR050C 348 nt3.21□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt3.21□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 SOK1YDR006C 2706 nt3.21□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 CDC24YAL041W 2565 nt3.21□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 SKT5YBL061C 2091 nt3.21□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 PFF1YBR074W 2931 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 TSC11YER093C 4293 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YDR344CYDR344C 444 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 RPL23BYER117W 414 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YER189WYER189W 369 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 RPL8BYLL045C 771 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 RPS28BYLR264W 204 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 INP52YNL106C 3552 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 ESL2YKR096W 3588 nt3.2□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 APC2YLR127C 2562 nt3.19□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 PSK2YOL045W 3306 nt3.19□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 GPI14YJR013W 1212 nt3.19□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YLR458WYLR458W 381 nt3.19□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 HCH1YNL281W 462 nt3.19□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 TRM7YBR061C 933 nt3.19□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YPR146CYPR146C 330 nt3.19□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 SKP2YNL311C 2292 nt3.19□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 AXL1YPR122W 3627 nt3.19□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 VPS64YDR200C 1815 nt3.19□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 RIF1YBR275C 5751 nt3.18□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 RPL35AYDL191W 363 nt3.18□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YDL211CYDL211C 1119 nt3.18□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 CCW14YLR390W-A 717 nt3.18□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 RIX1YHR197W 2292 nt3.18□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 RRM3YHR031C 2172 nt3.18□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 SMC2YFR031C 3513 nt3.17□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 PNC1YGL037C 651 nt3.17□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YGR069WYGR069W 336 nt3.17□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt3.17□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YIL174WYIL174W 228 nt3.17□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.17□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 TCP1YDR212W 1680 nt3.17□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 HTL1YCR020W-B 237 nt3.16□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 snR80snR80 171 nt3.16□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 CDC36YDL165W 576 nt3.16□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 YER121WYER121W 345 nt3.16□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 TIM13YGR181W 318 nt3.16□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 RAM2YKL019W 951 nt3.16□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 AI2Q0055 2565 nt3.16□□□□□ -1.9
HRQ1Q05549 ERP6YGL002W 651 nt3.15□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 YGL239CYGL239C 315 nt3.15□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 YLR294CYLR294C 330 nt3.15□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 DYN1YKR054C 12279 nt3.15□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 TRM2YKR056W 1920 nt3.15□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 TIM11YDR322C-A 291 nt3.14□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 YLR012CYLR012C 300 nt3.14□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 HTB2YBL002W 396 nt3.14□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 BAS1YKR099W 2436 nt3.14□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 YOL057WYOL057W 2136 nt3.14□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 ENA5YDR038C 3276 nt3.14□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 CAF120YNL278W 3183 nt3.14□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 RTT10YPL183C 3042 nt3.13□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 PSO2YMR137C 1986 nt3.13□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 CSN9YDR179C 489 nt3.13□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 YNL010WYNL010W 726 nt3.13□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 RPL40AYIL148W 387 nt3.12□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 YML037CYML037C 1023 nt3.12□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 PUF6YDR496C 1971 nt3.12□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 FLO1YAR050W 4614 nt3.12□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 PAC1YOR269W 1485 nt3.11□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 YDR048CYDR048C 315 nt3.11□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 RPS27AYKL156W 249 nt3.11□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 APC9YLR102C 798 nt3.11□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 snR49snR49 165 nt3.11□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 IKI3YLR384C 4050 nt3.11□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 NPR3YHL023C 3441 nt3.1□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 YAT2YER024W 2772 nt3.1□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 YMR324CYMR324C 243 nt3.1□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 RPL32YBL092W 393 nt3.1□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt3.1□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 DAD3YBR233W-A 285 nt3.1□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 PUF4YGL014W 2667 nt3.1□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 NAB3YPL190C 2409 nt3.1□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 ARP7YPR034W 1434 nt3.1□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 DBP10YDL031W 2988 nt3.09□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 TCB2YNL087W 3537 nt3.09□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 RAX2YLR084C 3663 nt3.09□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 RPL25YOL127W 429 nt3.09□□□□□ -1.91
HRQ1Q05549 GIN4YDR507C 3429 nt3.09□□□□□ -1.92
HRQ1Q05549 SRO77YBL106C 3033 nt3.09□□□□□ -1.92
HRQ1Q05549 ASG1YIL130W 2895 nt3.08□□□□□ -1.92
HRQ1Q05549 BPT1YLL015W 4680 nt3.08□□□□□ -1.92
HRQ1Q05549 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt3.08□□□□□ -1.92
HRQ1Q05549 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt3.08□□□□□ -1.92
HRQ1Q05549 YBR197CYBR197C 654 nt3.08□□□□□ -1.92
HRQ1Q05549 MET5YJR137C 4329 nt3.08□□□□□ -1.92
HRQ1Q05549 DUF1YOL087C 3351 nt3.08□□□□□ -1.92
HRQ1Q05549 DBP6YNR038W 1890 nt3.07□□□□□ -1.92
HRQ1Q05549 MAK21YDR060W 3078 nt3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.7 ms