Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 PET20YPL159C 762 nt0.89□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 MUK1YPL070W 1839 nt0.89□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 MSS11YMR164C 2277 nt0.89□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 SMY1YKL079W 1971 nt0.88□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YNL114CYNL114C 372 nt0.88□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YOR376WYOR376W 369 nt0.88□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 RRP15YPR143W 753 nt0.88□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 SEF1YBL066C 3447 nt0.88□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YDL211CYDL211C 1119 nt0.87□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YLL020CYLL020C 306 nt0.87□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 FYV6YNL133C 522 nt0.87□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 BEM2YER155C 6504 nt0.86□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YCR043CYCR043C 384 nt0.86□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 TSA2YDR453C 591 nt0.86□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YEL010WYEL010W 351 nt0.86□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 IMP3YHR148W 552 nt0.86□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 EMC5YIL027C 426 nt0.86□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt0.86□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YOL118CYOL118C 309 nt0.86□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 snR24snR24 89 nt0.86□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 VPS54YDR027C 2670 nt0.86□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.85□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 SPC1YJR010C-A 285 nt0.85□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 SPE1YKL184W 1401 nt0.84□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YCR016WYCR016W 873 nt0.84□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YDL032WYDL032W 312 nt0.84□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 YDR336WYDR336W 945 nt0.84□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 IST3YIR005W 447 nt0.84□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 RPC25YKL144C 639 nt0.84□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 GSP1YLR293C 660 nt0.84□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 RPB11YOL005C 363 nt0.84□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 HHT1YBR010W 411 nt0.84□□□□□ -2.27
PKR1Q03880 PPE1YHR075C 1203 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YLR255CYLR255C 354 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 RPS18BYML026C 441 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YBL083CYBL083C 426 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YOL024WYOL024W 519 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 ERP4YOR016C 624 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 SPR3YGR059W 1539 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 RRI1YDL216C 1323 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 SEC3YER008C 4011 nt0.83□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 BRO1YPL084W 2535 nt0.82□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 BUD3YCL014W 4911 nt0.82□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 MZM1YDR493W 372 nt0.82□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YGR242WYGR242W 309 nt0.82□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 IFH1YLR223C 3258 nt0.82□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 KAP120YPL125W 3099 nt0.82□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 SCC2YDR180W 4482 nt0.81□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YDL009CYDL009C 324 nt0.81□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YLR031WYLR031W 561 nt0.81□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 NOT5YPR072W 1683 nt0.81□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 ABM1YJR108W 372 nt0.8□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 RPL40BYKR094C 387 nt0.8□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YNL010WYNL010W 726 nt0.8□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 SHS1YDL225W 1656 nt0.8□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 ROM2YLR371W 4071 nt0.79□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 SEC28YIL076W 891 nt0.79□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 TIM18YOR297C 579 nt0.79□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 EAF1YDR359C 2949 nt0.79□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 MAK10YEL053C 2202 nt0.79□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 RTR1YER139C 681 nt0.78□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.78□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.78□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 YPL034WYPL034W 498 nt0.78□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 GPX2YBR244W 489 nt0.78□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 LST4YKL176C 2487 nt0.78□□□□□ -2.28
PKR1Q03880 ZRG17YNR039C 1818 nt0.78□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 STB6YKL072W 2301 nt0.77□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 SIP4YJL089W 2490 nt0.77□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 GEP7YGL057C 864 nt0.77□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt0.77□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.77□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 IRC13YOR235W 315 nt0.77□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 snR14snR14 160 nt0.77□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 RTC6YPL183W-A 282 nt0.77□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 NCS2YNL119W 1482 nt0.77□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 SAS3YBL052C 2496 nt0.77□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.76□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.76□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.76□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YGL217CYGL217C 342 nt0.76□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YHL037CYHL037C 402 nt0.76□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YOL162WYOL162W 648 nt0.76□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 IRC23YOR044W 474 nt0.76□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YOR169CYOR169C 465 nt0.76□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 NGG1YDR176W 2109 nt0.76□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 SEC5YDR166C 2916 nt0.75□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 CAJ1YER048C 1176 nt0.75□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt0.75□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YOR105WYOR105W 327 nt0.75□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 SWI4YER111C 3282 nt0.75□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YGR130CYGR130C 2451 nt0.75□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 CDC39YCR093W 6327 nt0.74□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 OSH6YKR003W 1347 nt0.74□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 ARG3YJL088W 1017 nt0.74□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 CGI121YML036W 546 nt0.74□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YNL179CYNL179C 438 nt0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.4 ms