Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL6Q02878 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms