Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC2Q02487 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms