Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms