Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXK2Q01167 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms