Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN7AQ01118 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN7AQ01118 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN7AQ01118 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms