Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK17Q00537 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms