Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT85P78386 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT85P78386 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT85P78386 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT85P78386 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT85P78386 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT85P78386 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT85P78386 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT85P78386 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT85P78386 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT85P78386 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT85P78386 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT85P78386 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT85P78386 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT85P78386 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT85P78386 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT85P78386 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT85P78386 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms