Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC5P78333 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC5P78333 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC5P78333 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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GPC5P78333 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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GPC5P78333 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC5P78333 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPC5P78333 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPC5P78333 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPC5P78333 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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GPC5P78333 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC5P78333 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC5P78333 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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