Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms