Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMO4P61968 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms