Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRPS1P60891 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms