Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1P60507 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms