Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC01547P58512 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01547P58512 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms