Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB25P57735 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB25P57735 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB25P57735 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB25P57735 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB25P57735 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB25P57735 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB25P57735 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB25P57735 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms