Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIPK4P57078 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms