Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BACE1P56817 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BACE1P56817 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BACE1P56817 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BACE1P56817 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BACE1P56817 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BACE1P56817 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BACE1P56817 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BACE1P56817 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BACE1P56817 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BACE1P56817 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BACE1P56817 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BACE1P56817 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BACE1P56817 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BACE1P56817 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BACE1P56817 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BACE1P56817 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BACE1P56817 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BACE1P56817 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BACE1P56817 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms