Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSWP56202 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSWP56202 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSWP56202 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSWP56202 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSWP56202 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSWP56202 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSWP56202 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSWP56202 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSWP56202 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSWP56202 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSWP56202 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSWP56202 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms